Йоахим Мюнхеберг заема след Гордон Голоб длъжността комодор на JG 77 "Herzas" когато предшественика му става Jafu 5.

Мюнхеберг е роден на 31 декември 1918 г. във Фридрихсхоф, Померания. Още в юношеството си Йохен, както го наричат, изпитва голямо удоволствие от спорта. При всеки удобен случай спортува. В младостта си си създава име на лекоатлет, но интересите му не се ограничават само с това. Йоахим проявява благосклонност и към философията. Неговият девиз гласи: "Gib acht, das dich das Leben lehre, die Ehren sind noch nicht die Ehre." На 4 декември 1936 г. Мюнхеберг постъпва в Луфтвафе като фанеюнкер във ВВУ в Дрезден, където завършва подготовката си една година по-късно. През септември 1938 г. постъпва на служба като оберфенрих в I./ JG 234 в Кьолн. На 8 ноември следва произвеждането му в чин лейтенант.

През септември 1939 г. той става групенадютант при III./JG 26. Първата си въздушна победа (един английски "Бленхайм"), постига на 7 ноември 1939 г. Следващите осем победи спечелва при нахлуването в Холандия. На 7 септември 1940 г. той вече има 17 въздушни победи. Междувременно е произведен в чин ст. л-т и назначен за щафелкапитен на 7./JG 26. Рицарският кръст му е връчен на 14 септември - деня, в който постига 20-тата си въздушна победа.

На 9 февруари 1941 г. за Мюнхеберг и неговата 7-ма ескадрила започваt тежък период в Средиземноморието, какъвто не се е случвал на нито една друга ескадрила. Одисеята започва с прехвърлянето им в Гела, Сицилия. При междинното прехвърляне от 6 до 8 април ескадрилата извършва бойни полети от Тарент срещу Югославия. От Сицилия действията са насочени основно срещу острова-крепост Малта. На 1 май Мюнхеберг сваля 3 Хърикейна, с което постига 41-вата си победа. Шест дни по-късно са му връчени Дъбовите листа към Рицарския кръст.

Следва предислокация в Катания, а след това в Малаои в Пелопонес. През май ескадрилата се пребазира в Солун и тогава , на 1 юни, със своите Ме 109Е те прелитат в Айн ел Газала, Либия, за действия срещу съюзническото наастъпление в Северна Африка. Ескадрилата работи съвместно с I./JG 27 под общото ръководство на к-н Едуард Нойман. До 29 юли 1941 г. Мюнхеберг има вече 48 победи, когато три дни след това получава заповед да прелети с частта си в Северна Франция. По време на бойните си действия в Средиземноморието 7./JG 26 сваля общо 52 противникови самолета, 25 от които се числят на сметката на Мюнхеберг. На 19 септември 1941 г. Мюнхеберг е произведен в к-н и едновременно с това назначен за групенкомандьор на II./JG 26. До края на 1941 г. довежда броя на победите си до 62, а на 2 юни 1942 г. постига 80-тата си въздушна победа. За отличните си успехи във въздушната война в Северна Африка той е удостоен с мечтания от всички италиански Златен медал за храброст. На 21 юли Мюнхеберг, имащ вече 83 победи, оставя ескадрата "Шлагетер", за да бъде въведен в дейността на ескадрен комодор на Източния фронт. След като комодорът на JG 51 "Мьолдерс", Карл-Готфрид Нордман излиза от строя поради тежко раняване, Йохен Мюнхеберг бива натоварен с временното му заместване на този пост. На 5 септември 1942 г. той постига 100-та си победа, а четири дни по-късно, след 103-тата, получава Мечовете към Рицарския кръст. В продължение на осемте седмици прекарани от Мюнхеберг на Източния фронт, той сваля 33 противника.

На 1 октомври 1942 г. Мюнхеберг приема от майор Голоб командуването на JG 77. Съединението в този момент се намира в предислокация от южния участък на Източния фронт към Северна Африка. Произведен в майор през декември, на 13 март 1943 г. Мюнхеберг достига 133-та си победа при полети срещу американските части в Тунис. Десет дни по-късно, през които междувременно печели още две победи, в 500-ия си боен полет комодорът повежда своята ескадра срещу американските изтребители. Този път JG 77 е смазана от численото превъзходство на противника.Още в началото на боя Мюнхеберг забелязва, че ги обкръжават. С ловък отклонителен маньовър той почти успява да измъкне хората си, но неговият Ме 109 не издържа претоварването и плоскостите му се прекършват. Мюнхеберг загива падайки с машината си. Първоначално е погребан в Ел Аоуния, но по-късно останките му са преместени във братска войнишка гробница в Тунис, където намират вечен покой повече от 500 военнослужещи от Луфтвафе. Ако Мюнхеберг не бе загинал толкова рано вероятно щеше да е един от най-добрите изтребители на Луфтвафе. Колкото по-изтъкнати стават личните му успехи, толкова по прямо и без заобикалки той нарича проблемите с истинските им имена като се доближава до сърцевината им. Хората му без колебание следват своя млад и интелигентен командир. Изключително дисциплиниран и съзнаващ дълга си, той винаги проявява разбиране към грешките и слабостите на другите без да изисква от никого това, което той самият не може да направи.